Договор о сотрудничестве заключён в декабре 2000 года.
Летом 2001 года Каунасский гуманитарный факультет Вильнюсского университета участвовал в организации летней практики студентов специализации «Балтистика»: быди организованы практические занятия по литовскому языку и лекции по литовской литературе, экскурсии по Каунасу, а также в Литовский Этнографический музей под открытым небом (Румшишкес) и поездка по Сувалькии.
Летом 2001 года Филологический факультет СПбГУ принимал студентов КГФ ВУ на курсах русского языка для иностранцев.